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COVID-19檢測(cè)小貼士
為了支持新型冠狀病毒(COVID-19)的檢測(cè)及疫苗研發(fā)工作,美國(guó)疾病預(yù)防控制中心(CDC)和中國(guó)政府都已完成了新型冠狀病毒基因組的測(cè)序并將結(jié)果提交至US NCBI GenBank®數(shù)據(jù)庫(kù) [1]。近日,IDT收到了來(lái)自世界各地研究人員關(guān)于新型冠狀病毒檢測(cè)試劑盒的詢問,以下是部分簡(jiǎn)要說(shuō)明。

美國(guó)疾病預(yù)防控制中心

美國(guó)疾病預(yù)防控制中心檢測(cè)試劑盒* 靶向COVID-19核衣殼蛋白基因(N-基因)上的不同位點(diǎn)。該試劑盒中的3組引物/探針必須與靶向人RNase P基因的內(nèi)部對(duì)照同時(shí)運(yùn)行。每個(gè)患者樣本共需進(jìn)行4次qPCR檢測(cè)。

1.該檢測(cè)試劑盒采用一步法qPCR反應(yīng)(即逆轉(zhuǎn)錄和后續(xù)qPCR反應(yīng)在同一步驟中完成);

2.所有3次N-基因檢測(cè)只有在Cq <35時(shí)方可視為陽(yáng)性結(jié)果;

3.RNase P內(nèi)部對(duì)照反應(yīng)是關(guān)鍵。Cq >35表示樣本提取不佳,需要重復(fù)實(shí)驗(yàn);

敬請(qǐng)查閱最新的美國(guó)疾病預(yù)防控制中心 COVID-19 RT-PCR檢測(cè)方法實(shí)驗(yàn)室指南,獲取相關(guān)文檔及實(shí)驗(yàn)方案。

與其他檢測(cè)試劑盒的比較

世界衛(wèi)生組織(WHO)

世界衛(wèi)生組織實(shí)驗(yàn)方案不同于美國(guó)疾病預(yù)防控制中心實(shí)驗(yàn)方案。世界衛(wèi)生組織建議需進(jìn)行3次qPCR反應(yīng)來(lái)確認(rèn)是否感染COVID-19。盡管這是一套完整的實(shí)驗(yàn)方案,但沒有美國(guó)疾病預(yù)防控制中心檢測(cè)方法來(lái)得快,因?yàn)樗枰B續(xù)進(jìn)行3次檢測(cè),且必須觀察到陽(yáng)性結(jié)果才能進(jìn)行下一次檢測(cè)。該實(shí)驗(yàn)方案按如下順序進(jìn)行檢測(cè):

1.冠狀病毒E-基因

2.RdRP基因:針對(duì)SARS 冠狀病毒和其他蝙蝠相關(guān)冠狀病毒

3.RdRP基因:針對(duì)COVID-19

中國(guó)疾病預(yù)防控制中心

中國(guó)疾病預(yù)防控制中心檢測(cè)試劑盒建議采用2組引物/探針。第1組靶向ORF 1ab,第2組用于確認(rèn)COVID-19的N-基因。

對(duì)照組

初步的電子模擬分析表明,搭配使用 IDT N-基因陽(yáng)性對(duì)照組模板**與美國(guó)疾病預(yù)防控制中心檢測(cè)試劑盒,與使用中國(guó)疾病預(yù)防控制中心、泰國(guó)衛(wèi)生部以及HKU的引物/探針組進(jìn)行類似實(shí)驗(yàn)獲得的結(jié)果相符。當(dāng)然,這是基于電子模擬研究,建議用戶在自己的實(shí)驗(yàn)室中對(duì)所選試劑盒進(jìn)行驗(yàn)證。


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